1 września 1986 roku w Biszczy dokonano inauguracji roku szkolnego w nowym budynku szkolnym, w którym naukę rozpoczęło 340 uczniów. Była to ośmioklasowa szkoła podstawowa. Pierwszym dyrektorem została pani Maria Nadolna, a funkcję zastępcy pełniła pani Stanisława Michalska.
Historia ośmioklasowej szkoły podstawowej kończy się w roku szkolnym 1999/2000 wprowadzeniem reformy oświatowej powołującej do istnienia gimnazja; czas nauki w szkole podstawowej został wówczas ograniczony do klasy szóstej.
W 1998 roku utworzono Samorządowy Zespól Szkolny, w skład którego weszło Samorządowe Przedszkole i Szkoła Podstawowa w Biszczy, a w roku 2002 SZS objął także istniejące już od 1999 r. gimnazjum.
Od 2016 roku, w związku z kolejną reformą oświaty, nastąpił proces wygaszania gimnazjów i od 1 września 2019 roku w budynku ponownie mieści się ośmioklasowa szkoła podstawowa oraz odziały przedszkolne dzieci sześcioletnich
(tzw. zerówka) i przedszkole.23 maja 2007 roku szkoła otrzymała sztandar oraz zaszczytne imię Dzieci Zamojszczyzny, by budując teraźniejszość, nie zapominać o tragicznych losach zamojskich dzieci z czasów II wojny światowej, by pamięć o nich przekazywać następnym pokoleniom.
Samorządowy Zespól Szkolny w Biszczy posiada własne tradycje, choć niektóre z nich podlegają modyfikacjom i są dopasowywane do potrzeb i specyfiki współczesnej edukacji. Cyklicznie organizowane są: Bal Absolwentów, Dzień Babci i Dziadka, Dzień Rodzica oraz Święto Szkoły, które uroczyście obchodzimy 23 maja w związku z rocznicą nadania naszej szkole imienia Dzieci Zamojszczyzny. Społeczność szkolna aktywnie uczestniczy w życiu lokalnym.Rokrocznie organizowane są wycieczki dla uczniów różnych grup wiekowych, wyjazdy i spotkania integracyjne na biwakach, rajdach rowerowych, tzw. ogniskach, odbywają się też wyjazdy zawodoznawcze do okolicznych szkół średnich.
Uczniowie różnych etapów edukacyjnych odnoszą sukcesy w konkursach wiedzy, artystycznych i sportowych, aktywnie włączają się w działanie Szkolnego Koła Wolontariatu.
Dyrekcja szkoły w latach 1986 – do dziś:
1 . 09. 1986 r. – 31. 08. 1992 r. - dyrektor p. Maria Nadolna
1. 09. 1986 r. – 31. 08. 1997 r.– z-ca dyrektora p. Stanisława Michalska
1. 09. 1992 r. - 31. 08. 2000 r. – dyrektor p. Irena Zawada
1. 09. 1997 r. – 31. 08. 2000 r.– z-ca dyrektora p. Teresa Pięciurek
1. 09. 2000 r. – 31. 08. 2002 r. – dyrektor szkoły podstawowej p. Elżbieta Blicharz
1. 09. 1999 r. – 31. 08. 2002 r. – dyrektor gimnazjum p. Anna Dajnowska
1. 09. 2002 r. – 31. 08. 2012 r. - dyrektor SZS p. Anna Dajnowska
1. 09. 2002 r. – 31.08.2012 r. - z-ca dyrektora SZS p. Barbara Żymiełko
1. 09. 2012 r. – dyrektor SZS p. Elżbieta Blicharz
1. 09. 2012 r. – z-ca dyrektora SZS p. Elżbieta Wasąg